Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TnfP06804 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TnfP06804 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TnfP06804 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TnfP06804 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TnfP06804 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TnfP06804 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TnfP06804 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TnfP06804 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnfP06804 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TnfP06804 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnfP06804 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnfP06804 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms