Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprcP06800 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprcP06800 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprcP06800 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PtprcP06800 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprcP06800 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprcP06800 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PtprcP06800 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PtprcP06800 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprcP06800 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PtprcP06800 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprcP06800 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprcP06800 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprcP06800 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PtprcP06800 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PtprcP06800 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprcP06800 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprcP06800 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprcP06800 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprcP06800 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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PtprcP06800 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprcP06800 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtprcP06800 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprcP06800 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtprcP06800 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtprcP06800 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtprcP06800 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PtprcP06800 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PtprcP06800 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PtprcP06800 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprcP06800 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms