Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06321 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06321 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06321 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06321 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms