Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tgfb1P04202 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb1P04202 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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