Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01746 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01746 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01746 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01746 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms