Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01734 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01734 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01734 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01734 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01734 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01734 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01734 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01734 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01734 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01734 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01734 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01734 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01734 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01734 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01734 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01734 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01734 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01734 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms