Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01679 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01679 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01679 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01679 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms