Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01669 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01669 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01669 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01669 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01669 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01669 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01669 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01669 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01669 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01669 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms