Protein–RNA interactions for Protein: P01634

Ig kappa chain V-V region MOPC 21, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01634 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01634 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01634 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01634 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01634 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01634 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms