Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo1O89026 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo1O89026 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo1O89026 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo1O89026 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo1O89026 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo1O89026 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms