Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MscO88940 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MscO88940 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MscO88940 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MscO88940 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MscO88940 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MscO88940 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MscO88940 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MscO88940 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MscO88940 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MscO88940 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MscO88940 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MscO88940 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MscO88940 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MscO88940 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MscO88940 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MscO88940 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MscO88940 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MscO88940 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MscO88940 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MscO88940 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MscO88940 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MscO88940 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms