Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms