Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms