Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms