Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3aO88508 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms