Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkcO88445 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms