Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms