Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nid2O88322 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nid2O88322 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nid2O88322 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nid2O88322 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nid2O88322 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms