Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp4O70480 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vamp4O70480 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms