Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms