Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms