Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms