Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms