Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap1O55125 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nipsnap1O55125 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap1O55125 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap1O55125 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap1O55125 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap1O55125 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms