Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms