Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NlkO54949 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NlkO54949 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NlkO54949 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms