Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffbO54788 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffbO54788 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DffbO54788 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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