Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffaO54786 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DffaO54786 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DffaO54786 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DffaO54786 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DffaO54786 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DffaO54786 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DffaO54786 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DffaO54786 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DffaO54786 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DffaO54786 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DffaO54786 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DffaO54786 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DffaO54786 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DffaO54786 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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