Protein–RNA interactions for Protein: O35949

Elovl3, Elongation of very long chain fatty acids protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elovl3O35949 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elovl3O35949 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elovl3O35949 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms