Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FxnO35943 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FxnO35943 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FxnO35943 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FxnO35943 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FxnO35943 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FxnO35943 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FxnO35943 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FxnO35943 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FxnO35943 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FxnO35943 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FxnO35943 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FxnO35943 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FxnO35943 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FxnO35943 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FxnO35943 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FxnO35943 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FxnO35943 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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FxnO35943 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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FxnO35943 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FxnO35943 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FxnO35943 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FxnO35943 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FxnO35943 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FxnO35943 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FxnO35943 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FxnO35943 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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