Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms