Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bnc1O35914 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnc1O35914 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms