Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms