Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn1mwO35599 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms