Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a6O35544 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms