Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Notch2O35516 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Notch2O35516 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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