Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms