Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atf6bO35451 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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