Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms