Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xbp1O35426 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xbp1O35426 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms