Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppef2O35385 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppef2O35385 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms