Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms