Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad6O35182 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms