Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms