Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtgisO35074 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms