Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sypl1O09117 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms