Protein–RNA interactions for Protein: O09061

Psmb1, Proteasome subunit beta type-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb1O09061 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb1O09061 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms