Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClockO08785 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClockO08785 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClockO08785 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClockO08785 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClockO08785 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClockO08785 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClockO08785 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClockO08785 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClockO08785 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClockO08785 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClockO08785 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClockO08785 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms