Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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