Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Usp35M0QWN7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Usp35M0QWN7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp35M0QWN7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp35M0QWN7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Usp35M0QWN7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Usp35M0QWN7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Usp35M0QWN7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Usp35M0QWN7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Usp35M0QWN7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Usp35M0QWN7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp35M0QWN7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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Usp35M0QWN7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp35M0QWN7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp35M0QWN7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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